Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvoplQ6PDF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms