Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms