Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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