Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms