Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd9P28357 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9P28357 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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