Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B4P23634 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms