Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18525 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18525 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P18525 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P18525 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18525 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18525 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18525 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms