Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRFP10586 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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