Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVV-1B6SEH8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms