Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms