Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
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SCN8AQ9UQD0 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN8AQ9UQD0 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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