Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
C9orf135Q5VTT2 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms