Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXD1Q16676 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXD1Q16676 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
FOXD1Q16676 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD1Q16676 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
FOXD1Q16676 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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