Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECM1Q16610 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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ECM1Q16610 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECM1Q16610 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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ECM1Q16610 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
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