Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTCH1Q13635 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PTCH1Q13635 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTCH1Q13635 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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