Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.9□□□□□ -2.87
TCOF1Q13428 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TCOF1Q13428 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.99□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TCOF1Q13428 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
TCOF1Q13428 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
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