Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SKP2Q13309 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SKP2Q13309 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SKP2Q13309 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SKP2Q13309 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms