Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ERCC8Q13216 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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ERCC8Q13216 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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ERCC8Q13216 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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ERCC8Q13216 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERCC8Q13216 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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ERCC8Q13216 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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ERCC8Q13216 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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ERCC8Q13216 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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ERCC8Q13216 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
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ERCC8Q13216 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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ERCC8Q13216 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ERCC8Q13216 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERCC8Q13216 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ERCC8Q13216 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
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