Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CHAF1BQ13112 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CHAF1BQ13112 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CHAF1BQ13112 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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