Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MRPL28Q13084 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MRPL28Q13084 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
MRPL28Q13084 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
MRPL28Q13084 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220 ms