Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMA1Q12791 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMA1Q12791 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMA1Q12791 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KCNMA1Q12791 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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