Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.3 ms