Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PTPRDP23468 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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PTPRDP23468 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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PTPRDP23468 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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PTPRDP23468 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PTPRDP23468 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
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PTPRDP23468 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
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PTPRDP23468 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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PTPRDP23468 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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PTPRDP23468 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
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PTPRDP23468 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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