Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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LHX9Q9NQ69 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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LHX9Q9NQ69 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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LHX9Q9NQ69 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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LHX9Q9NQ69 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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