Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNRNP35Q16560 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNRNP35Q16560 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNRNP35Q16560 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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