Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEC23BQ15437 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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SEC23BQ15437 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEC23BQ15437 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEC23BQ15437 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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