Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
UBE4AQ14139 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
UBE4AQ14139 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
UBE4AQ14139 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms