Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
SPTAN1Q13813 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SPTAN1Q13813 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
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