Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CUL1Q13616 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CUL1Q13616 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CUL1Q13616 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms