Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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FOXD4Q12950 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXD4Q12950 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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FOXD4Q12950 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
FOXD4Q12950 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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FOXD4Q12950 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
FOXD4Q12950 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
FOXD4Q12950 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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