Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXD13P35453 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXD13P35453 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HOXD13P35453 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HOXD13P35453 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms