Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HDAC6Q9UBN7 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HDAC6Q9UBN7 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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