Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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