Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD2Q9BSE4 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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