Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP43Q70EL4 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP43Q70EL4 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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USP43Q70EL4 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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USP43Q70EL4 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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USP43Q70EL4 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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USP43Q70EL4 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP43Q70EL4 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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