Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRNQ16849 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRNQ16849 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPRNQ16849 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRNQ16849 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.4 ms