Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.9 ms