Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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