Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SPTAN1Q13813 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SPTAN1Q13813 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SPTAN1Q13813 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.91□□□□□ -2.87
SPTAN1Q13813 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SPTAN1Q13813 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SPTAN1Q13813 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
SPTAN1Q13813 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.9 ms