Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCOA4Q13772 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCOA4Q13772 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCOA4Q13772 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NCOA4Q13772 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NCOA4Q13772 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms