Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL49Q13405 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL49Q13405 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.5 ms