Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NME3Q13232 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NME3Q13232 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NME3Q13232 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NME3Q13232 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NME3Q13232 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NME3Q13232 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NME3Q13232 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NME3Q13232 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NME3Q13232 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NME3Q13232 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NME3Q13232 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NME3Q13232 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NME3Q13232 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NME3Q13232 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NME3Q13232 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NME3Q13232 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NME3Q13232 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NME3Q13232 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NME3Q13232 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NME3Q13232 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NME3Q13232 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NME3Q13232 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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