Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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IFT88Q13099 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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IFT88Q13099 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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IFT88Q13099 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
IFT88Q13099 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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IFT88Q13099 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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IFT88Q13099 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
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IFT88Q13099 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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IFT88Q13099 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IFT88Q13099 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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