Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD10P28358 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
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HOXD10P28358 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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HOXD10P28358 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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HOXD10P28358 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD10P28358 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD10P28358 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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