Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
J3KRW8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
J3KRW8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
J3KRW8 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
J3KRW8 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
J3KRW8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
J3KRW8 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
J3KRW8 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
J3KRW8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
J3KRW8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
J3KRW8 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
J3KRW8 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
J3KRW8 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
J3KRW8 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
J3KRW8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
J3KRW8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
J3KRW8 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
J3KRW8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
J3KRW8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
J3KRW8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
J3KRW8 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
J3KRW8 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
J3KRW8 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
J3KRW8 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
J3KRW8 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
J3KRW8 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
J3KRW8 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
J3KRW8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
J3KRW8 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
J3KRW8 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
J3KRW8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
J3KRW8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
J3KRW8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
J3KRW8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
J3KRW8 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
J3KRW8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
J3KRW8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
J3KRW8 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
J3KRW8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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