Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD1Q9GZZ0 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD1Q9GZZ0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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