Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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