Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBXN4Q92575 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBXN4Q92575 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UBXN4Q92575 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBXN4Q92575 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UBXN4Q92575 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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