Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
BEST4Q8NFU0 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
BEST4Q8NFU0 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.2 ms