Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
RTL8BQ17RB0 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.7 ms