Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RTN1Q16799 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RTN1Q16799 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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RTN1Q16799 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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RTN1Q16799 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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RTN1Q16799 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTN1Q16799 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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